Une étude cartographie les centaines de bactéries qui vivent dans le vagin humain

Les scientifiques disent qu’ils ont pour la première fois effectué une analyse approfondie des bactéries qui vivent dans le vagin humain. Et ils semblent avoir trouvé plein de surprises.

Ces dernières années, beaucoup a été fait du microbiome intestinal: le monde symbiotique invisible des bactéries et autres micro-organismes qui vivent dans notre système digestif. Mais les bactéries vivent partout dans et sur le corps humain, y compris dans le vagin.

Comme pour le microbiome intestinal, les chercheurs soupçonnent qu’un microbiome vaginal équilibré est essentiel à la santé en général. Il joue probablement un rôle clé dans la prévention maladies sexuellement transmissibles et infections des voies urinaires, et cela peut Plus facile pour que les femmes tombent enceintes. Les infections bactériennes du vagin, quant à elles, perturbent le microbiome et ont été lié à un plus grand risque de naissance prématurée, de troubles inflammatoires chroniques et à un plus grand risque de autres infections.

La recherche sur le microbiome vaginal a jusqu’à présent suggéré qu’il est beaucoup moins diversifié que le microbiome intestinal, avec moins d’espèces distinctes de bactéries qui y vivent. Mais les auteurs d’une nouvelle étude aujourd’hui dans Nature Communications disent qu’ils sont les premiers à avoir créé un énorme catalogue génétique du microbiome vaginal.

Pour créer leur carte, les chercheurs ont analysé des centaines de «métagénomes» vaginaux – qui sont la somme totale de tout le matériel génétique d’un échantillon, qu’il provienne d’humains, de bactéries ou de virus. De cette soupe d’ADN, ils ont isolé près d’un million de gènes uniques non redondants qui appartenaient probablement à des bactéries. Ils ont utilisé ces gènes pour identifier des groupes distincts de bactéries. Le catalogue a ensuite été utilisé pour analyser plus de 1 700 autres métagénomes. Dans l’ensemble, l’étude portait sur des bactéries prélevées sur des femmes du monde entier, d’Amérique du Nord, d’Afrique et d’Asie.

Sans surprise, ils ont trouvé relativement peu d’espèces de bactéries qui vivent régulièrement dans le vagin, environ 300 environ (le microbiome intestinal a probablement plus d’un millier). Mais selon l’auteur principal de l’étude, Jacques Ravel, microbiologiste et chercheur en génomique à l’Université de Maryland School of Medicine, il y avait beaucoup de différences sur le plan génétique au sein d’une espèce elle-même.

« Il y a beaucoup plus de diversité entre les souches d’une bactérie, ce qui signifie que la femme peut être porteuse de gènes d’une bactérie très différents de ceux d’une autre. » Ravel a dit à Gizmodo par téléphone. « Donc, dans le microbiome d’une femme, même si elle est dominée par une espèce de bactérie, ce sont de nombreuses souches de cette espèce qui construisent une petite communauté, chacune contribuant à la fonction de cette communauté. »

Si tel est le cas, a ajouté Ravel, alors un microbiome vaginal sain ne consiste pas seulement à avoir le bon mélange d’espèces bactériennes, mais le bon mélange de souches d’une bactérie. Et c’est important de savoir si jamais nous voulons trouver un moyen d’équilibrer un microbiome hors de contrôle.

À l’heure actuelle, les médecins et les chercheurs mènent déjà des essais cliniques qui aident les gens à réinitialiser leur microbiome intestinal dysfonctionnel, généralement via une greffe fécale. Mais nous sommes toujours dans le premières étapes de trouver comment faire de même pour le microbiome vaginal.

Certains scientifiques ont théorisé que les gens peuvent simplement prendre des probiotiques oraux, mais cela ne fonctionnera probablement pas, a déclaré Ravel, car ce serait un long voyage pour que les bactéries survivent et atteignent le vagin (les bactéries devraient atteindre le rectum, puis le vagin). , et toujours en assez bonne forme pour le coloniser). D’autres ont montré succès précoce avec des sécrétions transplantées prélevées sur des donneurs qui sont appliquées par voie vaginale, mais cette méthode pourrait entraîner des problèmes de sécurité supplémentaires, similaires à transplantations fécales.

Ravel et son équipe pensent plutôt qu’ils peuvent utiliser leur catalogue et d’autres recherches pour créer des traitements de «médecine vivante» qui fournissent la combinaison optimale de souches bactériennes aux femmes dont les microbiomes ont mal tourné. L’année dernière, lui et d’autres cofondé la société de biotechnologie Luca Biologics, issue de son laboratoire à l’Université du Maryland. Ils prévoient de développer des traitements pour les infections urinaires récurrentes, les infections bactériennes du vagin et les naissances prématurées. Sur le plan de la recherche, ils prévoient également d’étudier comment le microbiome peut affecter le risque de maladies sexuellement transmissibles chez les femmes.

«Nous avons beaucoup appris de ce que devrait être le microbiome», a déclaré Ravel. « Et pour aller de l’avant, nous espérons que nous pourrons mettre ces idées en pratique et développer des interventions pour améliorer la santé des femmes. »