Wnous sommes tous un peu Néandertal. C’est la conclusion d’une étude qui used a nouvelle technique statistique à réviser des estimations de la mesure dans laquelle les humains modernes ont conservé l’ADN néandertalien. La recherche suggère que même les personnes d’ascendance africaine ont Nepatrimoine andertal, quelque chose qui était auparavant dans le doute.
Recherche publié aujourd’hui à Cell a identifié des traces importantes d’ascendance néandertalienne dans les populations africaines. Le nouvel article, co-écrit par le généticien Joshua Akey de l’Université de Princeton, affirme que «les individus africains ont un signal d’ascendance néandertalien plus fort qu’on ne le pensait.» La découverte complique notre compréhension des origines humaines aet les schémas de migration qui ont contribué à la constitution de notre espèce.
« Jusque là, les estimations de l’ascendance néandertalienne chez les Européens et les Asiatiques ont utilisé l’hypothèse selon laquelle les Africains n’ont pas d’ascendance néandertalienne, même si nous savions que ce n’était pas strictement vrai », a déclaré à Gizmodo Svante Pääbo, généticien à l’Institut Max Planck d’anthropologie évolutionniste. « Nous savions qu’il y en avait en Afrique », le résultat d’un supposé événement migratoire qui s’est produit il y a longtemps, a déclaré Pääbo, qui n’était pas impliqué dans la nouvelle recherche. Le nouvel article confirme ces hypothèses, suggérant des événements de métissage qui remontent à 100 000 à 200 000 ans.
Des enquêtes sur le génome néandertalien, qui a été séquencé en 2010, ont suggéré que les humains anatomiquement modernes (Homo sapiens) d’origine eurasienne ont conservé environ 2% d’ADN néandertalien. Cela a été considéré comme une preuve que les humains modernes se sont croisés avec les Néandertaliens alors qu’ils se répandaient hors d’Afrique, pénétrant au Moyen-Orient, en Europe et en Asie entre 80 000 et Il y a 50 000 ans.
Dans le même temps, les paléogénéticiens ont eu du mal à détecter traces d’ADN de Néandertal dans les populations africaines. Tson manque de preuves concordait avec le récit conventionnel, que les humains modernes qui ont quitté l’Afrique et par la suite croisé avec les Néandertaliens n’est jamais revenu, ou du moins pas d’une manière significative qui a eu un impact sur l’évolution humaine. La nouvelle recherche bouleverse maintenant cette notion, offrant des preuves suggérant qu’il y a plus d’ADN néandertalien chez les Africains que prévu. De plus, les preuves suggèrent que plusieurs événements de croisement se produisentrouge entre les humains et les Néandertaliens, y compris des épisodes qui remontent à plus de 100 000 ans.
« C’est une preuve supplémentaire que les humains modernes, ou les ancêtres des humains modernes, ont quitté l’Afrique plusieurs fois et se sont mélangés aux Néandertaliens », a déclaré Pääbo. «Ces humains modernes ne sont pas les ancêtres des humains actuels en Eurasie. Ils ont été au moins partiellement assimilés aux populations néandertaliennes », et cela« s’est produit il y a plus de 100 000 ans ».
Il y a deux raisons principales pour lesquelles il a été si difficile de trouver des séquences néandertaliennes chez des individus africains. La première raison est plutôt simple, et même un peu exaspérante: l’hypothèse injustifiée que très peu de Néandertaliens l’ascendance doit être trouvée chez les individus africains.
La deuxième raison est liée aux méthodes utilisées par les généticiens, mais elle est directement liée à la première raison.
«Les méthodes précédentes pour trouver des séquences néandertaliennes dans l’ADN des humains modernes utilisaient toutes une population de« référence »censée contenir peu ou pas d’ascendance néandertalienne, et cela a toujours été une population africaine», a expliqué Akey dans un e-mail à Gizmodo. «La raison pour laquelle une population humaine de référence a été utilisée est que les humains modernes et les Néandertaliens partagent un ancêtre commun récent et que de nombreux endroits dans nos génomes ressembleront à ceux de Néandertal simplement en raison de cette histoire évolutive partagée. L’utilisation d’une population de référence vous permet de soustraire ce signal d’ascendance partagée et d’identifier les séquences héritées du mélange (métissage). »
Le problème est que cette population de référence, c’est-à-dire génomes d’individus africains, a produit des estimations biaisées de l’ADN néandertalien parmi les populations humaines modernes. Pour corriger ce biais, Akey et ses collègues ont conçu une nouvelle méthode statistique, appelée IBDmix, qui ne nécessitait pas de population de référence, tout en permettant des recherches sur l’ascendance néandertalienne chez les individus africains, ce qui n’avait pas été fait auparavant.
IBD signifie «identité par descendance», et il signale des sections identiques d’ADN qui sont présente chez deux individus différents. Ces segments partagés sont considérés comme la preuve d’un ancêtre commun partagé; plus le segment est long, plus le lien supposé avec un ancêtre commun est fort.
Cette méthode sans référence a appliqué des caractéristiques connues de l’ADN de Neandertal, telles que la prévalence des allèles (mutations) et la longueur des MICI segments, pour identifier l’ascendance commune tlié aux anciens événements de métissage. Avec cette méthode, l’équipe a identifié l’ADN de Néandertal chez les Africains pour la toute première fois, tout en fournissant des estimations révisées de l’ADN de Néandertal dans d’autres populations.
«Cette nouvelle approche a permis aux auteurs d’évaluer la possibilité de la présence de matériel génétique néandertalien dans les populations africaines – quelque chose qui était auparavant« caché »en raison des hypothèses des méthodes précédemment utilisées, qui considéraient que les populations africaines n’avaient pas un tel mélange avec les Néandertaliens », A expliqué la paléoanthropologue Katerina Harvati de l’Université Eberhard Karls de Tübingen. « Le résultat surprenant a été qu’en fait, il y avait une contribution considérable de Néandertal au matériel génétique africain, qui était plus importante que ce que l’on soupçonnait auparavant », a déclaré Harvati, qui n’a pas participé à l’étude.
«Je pense que la conclusion la plus intéressante de notre travail est qu’il met en évidence que les humains modernes et les Néandertaliens interagissaient depuis des centaines de milliers d’années et qu’il y avait de nombreuses dispersions en provenance et à destination de l’Afrique.»
En moyenne, la quantité d’ADN de Néandertal était d’environ 55 millions de paires de bases par personne chez les Asiatiques, 51 millions de paires de bases par personne chez les Européens et 17 millions de paires de bases par personne chez les Africains, bien que ces quantités varient d’un individu à l’autre. . En termes de proportion globale d’ADN de Néandertal, Akey a déclaré que c’était « un peu difficile à définir car nous ne pouvons pas analyser toutes les parties du génome en raison de limitations techniques », mais une approximation approximative suggère 1,8% chez les Asiatiques, 1,7% chez les Européens et 0,5% chez les Africains.
«Je pense que la découverte la plus intéressante de notre travail est qu’il met en évidence que les humains modernes et les Néandertaliens interagissaient depuis des centaines de milliers d’années et qu’il y avait de nombreuses dispersions en provenance et à destination de l’Afrique », a déclaré Akey. «Il révèle une histoire plus nuancée et compliquée que celle précédemment reconnue et montre que l’héritage du flux de gènes entre les humains modernes et les Néandertaliens existe aujourd’hui chez tous les individus contemporains. »
En effet, cette recherche suggère que les humains modernes, après leur métissage avec les Néandertaliens, ont migré vers l’Afrique, mais elle pointe également vers d’anciens épisodes d’accouplement entre les ancêtres des humains modernes et des Néandertaliens peut-être aussi loin il y a 200 000 ans, une affirmation étayée par d’autres recherches.
« Cet article rejoint plusieurs études publiées récemment pour souligner l’importance des dispersions, des migrations de retour, et le croisement entre les lignées et les populations humaines, tant au Pléistocène que plus récemment, et renforce l’idée que l’évolution humaine était plus complexe qu’on ne le pensait auparavant », a expliqué Harvati. «Il prend également en charge les découvertes antérieures d’un ancien événement de métissage, il y a moins de 100 000 ans entre les premiers humains modernes et les Néandertaliens.»
Harvati a déclaré que cela avait été suggéré par des preuves paléogénétiques antérieures montrées dans plusieurs études différentes, ainsi que les archives fossiles.
«On sait que les premiers humains modernes se sont dispersés lors d’une migration précoce hors d’Afrique, il y a environ 200 000 ans, comme l’indiquent les récentes découvertes de fossiles en Grèce et en Israël (voir ici et ici), et aurait eu l’occasion de rencontrer et de se reproduire avec les Néandertaliens », a déclaré Harvati. « Les auteurs ont même émis l’hypothèsee qu’il pourrait y avoir eu plusieurs dispersions et métissages hors d’Afrique, dont seulement certains peuvent être détectés avec leurs ensembles de données et outils méthodologiques actuels. »
Fait intéressant, un groupe sœur des Néandertaliens, les mystérieux Denisoviens, ne faisait probablement pas partie de cette équation. Denisovans bifurqué de Néandertaliens il y a environ 400 000 ans et a vécu en Asie depuis des centaines de milliers d’années. Il «devient de plus en plus clair que les Néandertaliens ont été en contact génétique avec les populations africaines à plusieurs reprises au cours de leur histoire», ce qui contraste avec les Denisoviens, «qui étaient plus isolés d’Afrique», a déclaré Svante.
En termes de limitations, AKey a déclaré que son équipe n’avait analysé que les données génétiques d’un petit nombre de populations africaines et qu ‘ »un meilleur échantillonnage de la diversité génétique africaine sera nécessaire pour comprendre les modèles d’ascendance néandertalienne à travers l’Afrique ».
Harvati a déclaré que de nombreuses questions demeurent, y compris la contribution génétique des lignées africaines archaïques.
«Puisque nous n’avons pas de preuves paléogénétiques des fossiles africains, cela est difficile à évaluer et reste un facteur de complication, car la rétention du matériel génétique africain archaïque, ainsi que le croisement entre les premiers humains modernes et les lignées archaïques en Afrique elle-même a également été postulé. », A déclaré Harvati.
Sans aucun doute, Cette étude soulève de nouvelles questions importantes que les futurs chercheurs devront aborder. Au fil du temps et à chaque nouvelle percée scientifique, notre histoire évolutive est en quelque sorte devenir plus clair mais aussi beaucoup plus trouble. Bien que tentantes, les explications simplistes ne sont presque jamais correctes. Notre histoire est aussi compliquée que fascinante.
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