Une pléthore de souches bactériennes jusque-là inconnues liées à la chlamydia ont été trouvées dans les endroits les plus improbables: des sédiments sous l’Afond marin de l’Arctique. La découverte pose de nouvelles questions sur ce groupe diversifié et durable de bactéries et comment ils en sont venus à infecter les humains et les autres animaux.
La chlamydia est la MST le plus souvent rapporté aux États-Unis, et il est causé par une infection de la Chlamydia trachomatis bactérie. Depuis 1994, la chlamydia a constitué la plus grande proportion de toutes les MST signalé aux centres américains pour Contrôle et prévention des maladies.
Cette bactérie et ses cousins apparentés, collectivement appelés Chlamydiae, peuvent également infecter d’autres organismes, ce qui leur permet survivre et se reproduire. Les scientifiques les appellent «parasites intracellulaires obligatoires», ce qui signifie qu’ils ne peuvent se reproduire qu’à l’intérieur d’une cellule hôte. En plus des humains et d’autres animaux (tels que koalas), Les Chlamydiae s’attaquent à des micro-organismes plus complexes qu’eux, à savoir les eucaryotes marins tels que les amibes, les algues et le plancton.
Les Chlamydiae sont connu pour habiter un large éventail d’habitats, mais en tant que recherche publié dans Current Biology montre, leur gamme écologique est beaucoup plus diversifiée que nous ne l’aurions jamais imaginé. Le nouveau document, dirigé par le microbiologiste Thijs Ettema de l’Université de Wageningen & Research aux Pays-Bas, montre qu’une population diversifiée de Chlamydiae existe dans lespression, bassesédiments d’oxygène sous le plancher océanique arctique.
« Trouver des Chlamydiae dans cet environnement était complètement inattendu, et bien sûr, nous avons posé la question, que diable faisaient-ils là-bas? » a demandé Jennah Dharamshi, chercheuse à l’Université suédoise d’Uppsala et première auteure de la nouvelle étude, dans un communiqué de presse.
L’emplacement inhabituel des Chlamydiae indique la durabilité et la flexibilité de ce groupe bactérien, tout en offrant de nouvelles perspectives sur son évolution et comment il est venu infecter la macrodes organismes comme humains. Cela dit, les chercheurs n’ont pas été en mesure d’identifier des hôtes dans les sédiments marins, ni de cultiver aucun des Chlamydiae récemment découverts dans leur laboratoire (il n’est pas facile de simuler l’environnement à haute pression et à faible teneur en oxygène dans lequel ils ont été trouvés). On ne sait pas non plus immédiatement comment cette bactérie s’est frayée un chemin dans les profondeurs de l’océan et dans nos parties génitales, si c’est effectivement la voie empruntée. En toute honnêteté, le nouveau document a tendance à poser plus de questions qu’il n’en répond, mettant en évidence de nouvelles pistes passionnantes d’exploration et d’enquête scientifique.
« Les chlamydiae ont probablement été manquées dans de nombreuses enquêtes antérieures sur la diversité microbienne », a déclaré Daniel Tamari, co-auteur de l’étude et chercheur à Wageningen University & Research, dans le communiqué de presse. « Ce groupe de bactéries pourrait jouer un rôle beaucoup plus important en écologie marine que nous ne le pensions auparavant. »
On a découvert que les lignées de Chlamydiae auparavant inconnues «dominaient les communautés microbiennes» dans dessédiments marins privés (anoxiques), selon le nouveau document. Ces sédiments étaient situés au château de Loki, une série de bouches hydrothermales en eau profonde situé entre Norfaçon et le Groenland. Tes bactéries ont été trouvées dans des carottes d’échantillons situées à plusieurs pieds sous le plancher océanique – un environnement exclusif aux micro-organismes (par opposition aux animaux plus gros, comme les étoiles cassantes ou les palourdes).
L’analyse des échantillons a montré que plus de 43 pour cent de toutes les bactéries trouvées dans les sédiments étaient des membres de Chlamydiae. À de si grandes quantités, cela signifie probablement que ces micro-organismes ont un impact sérieux sur l’écologie locale de cet environnement privé d’oxygène. Au total, les chercheurs ont pu identifier 163 espèces uniques de Chlamydiae, dont une s’est avérée être un proche parent de Chlamydia trachomatis, la bactérie responsable de la MST chez l’homme.
« La découverte que Chlamydia a des parents de sédiments marins, nous a donné de nouvelles perspectives sur la façon dont les pathogènes chlamydia ont évolué,», A déclaré Dharamshi.
Comme indiqué, les chercheurs n’ont pu trouver aucun hôte eucaryote dans les échantillons, ils ne sont donc pas certains de l’espèce dont ils dépendent. Cela dit, une analyse génétique préliminaire des échantillons suggère qu’ils possèdent les caractéristiques physiologiques requises des parasites intracellulaires obligatoires. Les hôtes doivent donc existent – il suffit de les trouver.
«Chaque fois que nous explorons un environnement différent, nous découvrons des groupes de microbes nouveaux pour la science. Cela nous indique tout ce qu’il reste à découvrir », a déclaré Ettema.
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